1	# Generated by scripts/gen_templates.py from the PDB Chemical
2	# Component Dictionary (https://files.rcsb.org/ligands/).
3	# DO NOT EDIT: regenerate with the script. Flat String lists
4	# (Data, reusable): atoms alternate name/element-symbol, bonds
5	# alternate the two names. CCD charges are formal, not partial.
6	# Leaving atoms (OXT, terminal H) stay listed; Bend filters by
7	# presence, so OXT bonds fire only where OXT exists.
8	import Base
9	
10	# --- ALA: 13 atoms, 12 bonds. ---
11	def tpl_ALA_atoms() -> List<&2, String>:
12	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB1", "H", "HB2", "H", "HB3", "H", "HXT", "H"]
13	def tpl_ALA_bonds() -> List<&2, String>:
14	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "HB1", "CB", "HB2", "CB", "HB3", "OXT", "HXT"]
15	# --- ARG: 27 atoms, 26 bonds. ---
16	def tpl_ARG_atoms() -> List<&2, String>:
17	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "CG", "C", "CD", "C", "NE", "N", "CZ", "C", "NH1", "N", "NH2", "N", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB2", "H", "HB3", "H", "HG2", "H", "HG3", "H", "HD2", "H", "HD3", "H", "HE", "H", "HH11", "H", "HH12", "H", "HH21", "H", "HH22", "H", "HXT", "H"]
18	def tpl_ARG_bonds() -> List<&2, String>:
19	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "CG", "CB", "HB2", "CB", "HB3", "CG", "CD", "CG", "HG2", "CG", "HG3", "CD", "NE", "CD", "HD2", "CD", "HD3", "NE", "CZ", "NE", "HE", "CZ", "NH1", "CZ", "NH2", "NH1", "HH11", "NH1", "HH12", "NH2", "HH21", "NH2", "HH22", "OXT", "HXT"]
20	# --- ASN: 17 atoms, 16 bonds. ---
21	def tpl_ASN_atoms() -> List<&2, String>:
22	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "CG", "C", "OD1", "O", "ND2", "N", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB2", "H", "HB3", "H", "HD21", "H", "HD22", "H", "HXT", "H"]
23	def tpl_ASN_bonds() -> List<&2, String>:
24	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "CG", "CB", "HB2", "CB", "HB3", "CG", "OD1", "CG", "ND2", "ND2", "HD21", "ND2", "HD22", "OXT", "HXT"]
25	# --- ASP: 16 atoms, 15 bonds. ---
26	def tpl_ASP_atoms() -> List<&2, String>:
27	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "CG", "C", "OD1", "O", "OD2", "O", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB2", "H", "HB3", "H", "HD2", "H", "HXT", "H"]
28	def tpl_ASP_bonds() -> List<&2, String>:
29	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "CG", "CB", "HB2", "CB", "HB3", "CG", "OD1", "CG", "OD2", "OD2", "HD2", "OXT", "HXT"]
30	# --- CYS: 14 atoms, 13 bonds. ---
31	def tpl_CYS_atoms() -> List<&2, String>:
32	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "SG", "S", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB2", "H", "HB3", "H", "HG", "H", "HXT", "H"]
33	def tpl_CYS_bonds() -> List<&2, String>:
34	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "SG", "CB", "HB2", "CB", "HB3", "SG", "HG", "OXT", "HXT"]
35	# --- GLN: 20 atoms, 19 bonds. ---
36	def tpl_GLN_atoms() -> List<&2, String>:
37	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "CG", "C", "CD", "C", "OE1", "O", "NE2", "N", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB2", "H", "HB3", "H", "HG2", "H", "HG3", "H", "HE21", "H", "HE22", "H", "HXT", "H"]
38	def tpl_GLN_bonds() -> List<&2, String>:
39	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "CG", "CB", "HB2", "CB", "HB3", "CG", "CD", "CG", "HG2", "CG", "HG3", "CD", "OE1", "CD", "NE2", "NE2", "HE21", "NE2", "HE22", "OXT", "HXT"]
40	# --- GLU: 19 atoms, 18 bonds. ---
41	def tpl_GLU_atoms() -> List<&2, String>:
42	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "CG", "C", "CD", "C", "OE1", "O", "OE2", "O", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB2", "H", "HB3", "H", "HG2", "H", "HG3", "H", "HE2", "H", "HXT", "H"]
43	def tpl_GLU_bonds() -> List<&2, String>:
44	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "CG", "CB", "HB2", "CB", "HB3", "CG", "CD", "CG", "HG2", "CG", "HG3", "CD", "OE1", "CD", "OE2", "OE2", "HE2", "OXT", "HXT"]
45	# --- GLY: 10 atoms, 9 bonds. ---
46	def tpl_GLY_atoms() -> List<&2, String>:
47	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA2", "H", "HA3", "H", "HXT", "H"]
48	def tpl_GLY_bonds() -> List<&2, String>:
49	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "HA2", "CA", "HA3", "C", "O", "C", "OXT", "OXT", "HXT"]
50	# --- HIS: 21 atoms, 21 bonds. ---
51	def tpl_HIS_atoms() -> List<&2, String>:
52	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "CG", "C", "ND1", "N", "CD2", "C", "CE1", "C", "NE2", "N", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB2", "H", "HB3", "H", "HD1", "H", "HD2", "H", "HE1", "H", "HE2", "H", "HXT", "H"]
53	def tpl_HIS_bonds() -> List<&2, String>:
54	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "CG", "CB", "HB2", "CB", "HB3", "CG", "ND1", "CG", "CD2", "ND1", "CE1", "ND1", "HD1", "CD2", "NE2", "CD2", "HD2", "CE1", "NE2", "CE1", "HE1", "NE2", "HE2", "OXT", "HXT"]
55	# --- ILE: 22 atoms, 21 bonds. ---
56	def tpl_ILE_atoms() -> List<&2, String>:
57	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "CG1", "C", "CG2", "C", "CD1", "C", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB", "H", "HG12", "H", "HG13", "H", "HG21", "H", "HG22", "H", "HG23", "H", "HD11", "H", "HD12", "H", "HD13", "H", "HXT", "H"]
58	def tpl_ILE_bonds() -> List<&2, String>:
59	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "CG1", "CB", "CG2", "CB", "HB", "CG1", "CD1", "CG1", "HG12", "CG1", "HG13", "CG2", "HG21", "CG2", "HG22", "CG2", "HG23", "CD1", "HD11", "CD1", "HD12", "CD1", "HD13", "OXT", "HXT"]
60	# --- LEU: 22 atoms, 21 bonds. ---
61	def tpl_LEU_atoms() -> List<&2, String>:
62	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "CG", "C", "CD1", "C", "CD2", "C", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB2", "H", "HB3", "H", "HG", "H", "HD11", "H", "HD12", "H", "HD13", "H", "HD21", "H", "HD22", "H", "HD23", "H", "HXT", "H"]
63	def tpl_LEU_bonds() -> List<&2, String>:
64	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "CG", "CB", "HB2", "CB", "HB3", "CG", "CD1", "CG", "CD2", "CG", "HG", "CD1", "HD11", "CD1", "HD12", "CD1", "HD13", "CD2", "HD21", "CD2", "HD22", "CD2", "HD23", "OXT", "HXT"]
65	# --- LYS: 25 atoms, 24 bonds. ---
66	def tpl_LYS_atoms() -> List<&2, String>:
67	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "CG", "C", "CD", "C", "CE", "C", "NZ", "N", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB2", "H", "HB3", "H", "HG2", "H", "HG3", "H", "HD2", "H", "HD3", "H", "HE2", "H", "HE3", "H", "HZ1", "H", "HZ2", "H", "HZ3", "H", "HXT", "H"]
68	def tpl_LYS_bonds() -> List<&2, String>:
69	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "CG", "CB", "HB2", "CB", "HB3", "CG", "CD", "CG", "HG2", "CG", "HG3", "CD", "CE", "CD", "HD2", "CD", "HD3", "CE", "NZ", "CE", "HE2", "CE", "HE3", "NZ", "HZ1", "NZ", "HZ2", "NZ", "HZ3", "OXT", "HXT"]
70	# --- MET: 20 atoms, 19 bonds. ---
71	def tpl_MET_atoms() -> List<&2, String>:
72	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "CG", "C", "SD", "S", "CE", "C", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB2", "H", "HB3", "H", "HG2", "H", "HG3", "H", "HE1", "H", "HE2", "H", "HE3", "H", "HXT", "H"]
73	def tpl_MET_bonds() -> List<&2, String>:
74	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "CG", "CB", "HB2", "CB", "HB3", "CG", "SD", "CG", "HG2", "CG", "HG3", "SD", "CE", "CE", "HE1", "CE", "HE2", "CE", "HE3", "OXT", "HXT"]
75	# --- PHE: 23 atoms, 23 bonds. ---
76	def tpl_PHE_atoms() -> List<&2, String>:
77	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "CG", "C", "CD1", "C", "CD2", "C", "CE1", "C", "CE2", "C", "CZ", "C", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB2", "H", "HB3", "H", "HD1", "H", "HD2", "H", "HE1", "H", "HE2", "H", "HZ", "H", "HXT", "H"]
78	def tpl_PHE_bonds() -> List<&2, String>:
79	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "CG", "CB", "HB2", "CB", "HB3", "CG", "CD1", "CG", "CD2", "CD1", "CE1", "CD1", "HD1", "CD2", "CE2", "CD2", "HD2", "CE1", "CZ", "CE1", "HE1", "CE2", "CZ", "CE2", "HE2", "CZ", "HZ", "OXT", "HXT"]
80	# --- PRO: 17 atoms, 17 bonds. ---
81	def tpl_PRO_atoms() -> List<&2, String>:
82	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "CG", "C", "CD", "C", "OXT", "O", "H", "H", "HA", "H", "HB2", "H", "HB3", "H", "HG2", "H", "HG3", "H", "HD2", "H", "HD3", "H", "HXT", "H"]
83	def tpl_PRO_bonds() -> List<&2, String>:
84	  ["N", "CA", "N", "CD", "N", "H", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "CG", "CB", "HB2", "CB", "HB3", "CG", "CD", "CG", "HG2", "CG", "HG3", "CD", "HD2", "CD", "HD3", "OXT", "HXT"]
85	# --- SER: 14 atoms, 13 bonds. ---
86	def tpl_SER_atoms() -> List<&2, String>:
87	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "OG", "O", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB2", "H", "HB3", "H", "HG", "H", "HXT", "H"]
88	def tpl_SER_bonds() -> List<&2, String>:
89	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "OG", "CB", "HB2", "CB", "HB3", "OG", "HG", "OXT", "HXT"]
90	# --- THR: 17 atoms, 16 bonds. ---
91	def tpl_THR_atoms() -> List<&2, String>:
92	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "OG1", "O", "CG2", "C", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB", "H", "HG1", "H", "HG21", "H", "HG22", "H", "HG23", "H", "HXT", "H"]
93	def tpl_THR_bonds() -> List<&2, String>:
94	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "OG1", "CB", "CG2", "CB", "HB", "OG1", "HG1", "CG2", "HG21", "CG2", "HG22", "CG2", "HG23", "OXT", "HXT"]
95	# --- TRP: 27 atoms, 28 bonds. ---
96	def tpl_TRP_atoms() -> List<&2, String>:
97	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "CG", "C", "CD1", "C", "CD2", "C", "NE1", "N", "CE2", "C", "CE3", "C", "CZ2", "C", "CZ3", "C", "CH2", "C", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB2", "H", "HB3", "H", "HD1", "H", "HE1", "H", "HE3", "H", "HZ2", "H", "HZ3", "H", "HH2", "H", "HXT", "H"]
98	def tpl_TRP_bonds() -> List<&2, String>:
99	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "CG", "CB", "HB2", "CB", "HB3", "CG", "CD1", "CG", "CD2", "CD1", "NE1", "CD1", "HD1", "CD2", "CE2", "CD2", "CE3", "NE1", "CE2", "NE1", "HE1", "CE2", "CZ2", "CE3", "CZ3", "CE3", "HE3", "CZ2", "CH2", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "CH2", "CZ3", "HZ3", "CH2", "HH2", "OXT", "HXT"]
100	# --- TYR: 24 atoms, 24 bonds. ---
101	def tpl_TYR_atoms() -> List<&2, String>:
102	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "CG", "C", "CD1", "C", "CD2", "C", "CE1", "C", "CE2", "C", "CZ", "C", "OH", "O", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB2", "H", "HB3", "H", "HD1", "H", "HD2", "H", "HE1", "H", "HE2", "H", "HH", "H", "HXT", "H"]
103	def tpl_TYR_bonds() -> List<&2, String>:
104	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "CG", "CB", "HB2", "CB", "HB3", "CG", "CD1", "CG", "CD2", "CD1", "CE1", "CD1", "HD1", "CD2", "CE2", "CD2", "HD2", "CE1", "CZ", "CE1", "HE1", "CE2", "CZ", "CE2", "HE2", "CZ", "OH", "OH", "HH", "OXT", "HXT"]
105	# --- VAL: 19 atoms, 18 bonds. ---
106	def tpl_VAL_atoms() -> List<&2, String>:
107	  ["N", "N", "CA", "C", "C", "C", "O", "O", "CB", "C", "CG1", "C", "CG2", "C", "OXT", "O", "H", "H", "H2", "H", "HA", "H", "HB", "H", "HG11", "H", "HG12", "H", "HG13", "H", "HG21", "H", "HG22", "H", "HG23", "H", "HXT", "H"]
108	def tpl_VAL_bonds() -> List<&2, String>:
109	  ["N", "CA", "N", "H", "N", "H2", "CA", "C", "CA", "CB", "CA", "HA", "C", "O", "C", "OXT", "CB", "CG1", "CB", "CG2", "CB", "HB", "CG1", "HG11", "CG1", "HG12", "CG1", "HG13", "CG2", "HG21", "CG2", "HG22", "CG2", "HG23", "OXT", "HXT"]
110	
111	# Template atoms by residue name (unknown -> empty).
112	
113	def tpl_atoms_HIP(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
114	  match hit:
115	    case True{}:
116	      tpl_HIS_atoms()
117	    case False{}:
118	      Nil{}
119	
120	def tpl_atoms_HID(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
121	  match hit:
122	    case True{}:
123	      tpl_HIS_atoms()
124	    case False{}:
125	      tpl_atoms_HIP(String.eq(res, "HIP"), res)
126	
127	def tpl_atoms_HIE(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
128	  match hit:
129	    case True{}:
130	      tpl_HIS_atoms()
131	    case False{}:
132	      tpl_atoms_HID(String.eq(res, "HID"), res)
133	
134	def tpl_atoms_VAL(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
135	  match hit:
136	    case True{}:
137	      tpl_VAL_atoms()
138	    case False{}:
139	      tpl_atoms_HIE(String.eq(res, "HIE"), res)
140	
141	def tpl_atoms_TYR(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
142	  match hit:
143	    case True{}:
144	      tpl_TYR_atoms()
145	    case False{}:
146	      tpl_atoms_VAL(String.eq(res, "VAL"), res)
147	
148	def tpl_atoms_TRP(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
149	  match hit:
150	    case True{}:
151	      tpl_TRP_atoms()
152	    case False{}:
153	      tpl_atoms_TYR(String.eq(res, "TYR"), res)
154	
155	def tpl_atoms_THR(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
156	  match hit:
157	    case True{}:
158	      tpl_THR_atoms()
159	    case False{}:
160	      tpl_atoms_TRP(String.eq(res, "TRP"), res)
161	
162	def tpl_atoms_SER(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
163	  match hit:
164	    case True{}:
165	      tpl_SER_atoms()
166	    case False{}:
167	      tpl_atoms_THR(String.eq(res, "THR"), res)
168	
169	def tpl_atoms_PRO(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
170	  match hit:
171	    case True{}:
172	      tpl_PRO_atoms()
173	    case False{}:
174	      tpl_atoms_SER(String.eq(res, "SER"), res)
175	
176	def tpl_atoms_PHE(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
177	  match hit:
178	    case True{}:
179	      tpl_PHE_atoms()
180	    case False{}:
181	      tpl_atoms_PRO(String.eq(res, "PRO"), res)
182	
183	def tpl_atoms_MET(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
184	  match hit:
185	    case True{}:
186	      tpl_MET_atoms()
187	    case False{}:
188	      tpl_atoms_PHE(String.eq(res, "PHE"), res)
189	
190	def tpl_atoms_LYS(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
191	  match hit:
192	    case True{}:
193	      tpl_LYS_atoms()
194	    case False{}:
195	      tpl_atoms_MET(String.eq(res, "MET"), res)
196	
197	def tpl_atoms_LEU(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
198	  match hit:
199	    case True{}:
200	      tpl_LEU_atoms()
201	    case False{}:
202	      tpl_atoms_LYS(String.eq(res, "LYS"), res)
203	
204	def tpl_atoms_ILE(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
205	  match hit:
206	    case True{}:
207	      tpl_ILE_atoms()
208	    case False{}:
209	      tpl_atoms_LEU(String.eq(res, "LEU"), res)
210	
211	def tpl_atoms_HIS(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
212	  match hit:
213	    case True{}:
214	      tpl_HIS_atoms()
215	    case False{}:
216	      tpl_atoms_ILE(String.eq(res, "ILE"), res)
217	
218	def tpl_atoms_GLY(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
219	  match hit:
220	    case True{}:
221	      tpl_GLY_atoms()
222	    case False{}:
223	      tpl_atoms_HIS(String.eq(res, "HIS"), res)
224	
225	def tpl_atoms_GLU(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
226	  match hit:
227	    case True{}:
228	      tpl_GLU_atoms()
229	    case False{}:
230	      tpl_atoms_GLY(String.eq(res, "GLY"), res)
231	
232	def tpl_atoms_GLN(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
233	  match hit:
234	    case True{}:
235	      tpl_GLN_atoms()
236	    case False{}:
237	      tpl_atoms_GLU(String.eq(res, "GLU"), res)
238	
239	def tpl_atoms_CYS(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
240	  match hit:
241	    case True{}:
242	      tpl_CYS_atoms()
243	    case False{}:
244	      tpl_atoms_GLN(String.eq(res, "GLN"), res)
245	
246	def tpl_atoms_ASP(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
247	  match hit:
248	    case True{}:
249	      tpl_ASP_atoms()
250	    case False{}:
251	      tpl_atoms_CYS(String.eq(res, "CYS"), res)
252	
253	def tpl_atoms_ASN(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
254	  match hit:
255	    case True{}:
256	      tpl_ASN_atoms()
257	    case False{}:
258	      tpl_atoms_ASP(String.eq(res, "ASP"), res)
259	
260	def tpl_atoms_ARG(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
261	  match hit:
262	    case True{}:
263	      tpl_ARG_atoms()
264	    case False{}:
265	      tpl_atoms_ASN(String.eq(res, "ASN"), res)
266	
267	def tpl_atoms_ALA(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
268	  match hit:
269	    case True{}:
270	      tpl_ALA_atoms()
271	    case False{}:
272	      tpl_atoms_ARG(String.eq(res, "ARG"), res)
273	
274	def tpl_atoms_for(+res: String) -> List<&2, String>:
275	  tpl_atoms_ALA(String.eq(res, "ALA"), res)
276	
277	# Template bonds by residue name (unknown -> empty).
278	
279	def tpl_bonds_HIP(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
280	  match hit:
281	    case True{}:
282	      tpl_HIS_bonds()
283	    case False{}:
284	      Nil{}
285	
286	def tpl_bonds_HID(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
287	  match hit:
288	    case True{}:
289	      tpl_HIS_bonds()
290	    case False{}:
291	      tpl_bonds_HIP(String.eq(res, "HIP"), res)
292	
293	def tpl_bonds_HIE(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
294	  match hit:
295	    case True{}:
296	      tpl_HIS_bonds()
297	    case False{}:
298	      tpl_bonds_HID(String.eq(res, "HID"), res)
299	
300	def tpl_bonds_VAL(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
301	  match hit:
302	    case True{}:
303	      tpl_VAL_bonds()
304	    case False{}:
305	      tpl_bonds_HIE(String.eq(res, "HIE"), res)
306	
307	def tpl_bonds_TYR(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
308	  match hit:
309	    case True{}:
310	      tpl_TYR_bonds()
311	    case False{}:
312	      tpl_bonds_VAL(String.eq(res, "VAL"), res)
313	
314	def tpl_bonds_TRP(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
315	  match hit:
316	    case True{}:
317	      tpl_TRP_bonds()
318	    case False{}:
319	      tpl_bonds_TYR(String.eq(res, "TYR"), res)
320	
321	def tpl_bonds_THR(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
322	  match hit:
323	    case True{}:
324	      tpl_THR_bonds()
325	    case False{}:
326	      tpl_bonds_TRP(String.eq(res, "TRP"), res)
327	
328	def tpl_bonds_SER(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
329	  match hit:
330	    case True{}:
331	      tpl_SER_bonds()
332	    case False{}:
333	      tpl_bonds_THR(String.eq(res, "THR"), res)
334	
335	def tpl_bonds_PRO(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
336	  match hit:
337	    case True{}:
338	      tpl_PRO_bonds()
339	    case False{}:
340	      tpl_bonds_SER(String.eq(res, "SER"), res)
341	
342	def tpl_bonds_PHE(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
343	  match hit:
344	    case True{}:
345	      tpl_PHE_bonds()
346	    case False{}:
347	      tpl_bonds_PRO(String.eq(res, "PRO"), res)
348	
349	def tpl_bonds_MET(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
350	  match hit:
351	    case True{}:
352	      tpl_MET_bonds()
353	    case False{}:
354	      tpl_bonds_PHE(String.eq(res, "PHE"), res)
355	
356	def tpl_bonds_LYS(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
357	  match hit:
358	    case True{}:
359	      tpl_LYS_bonds()
360	    case False{}:
361	      tpl_bonds_MET(String.eq(res, "MET"), res)
362	
363	def tpl_bonds_LEU(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
364	  match hit:
365	    case True{}:
366	      tpl_LEU_bonds()
367	    case False{}:
368	      tpl_bonds_LYS(String.eq(res, "LYS"), res)
369	
370	def tpl_bonds_ILE(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
371	  match hit:
372	    case True{}:
373	      tpl_ILE_bonds()
374	    case False{}:
375	      tpl_bonds_LEU(String.eq(res, "LEU"), res)
376	
377	def tpl_bonds_HIS(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
378	  match hit:
379	    case True{}:
380	      tpl_HIS_bonds()
381	    case False{}:
382	      tpl_bonds_ILE(String.eq(res, "ILE"), res)
383	
384	def tpl_bonds_GLY(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
385	  match hit:
386	    case True{}:
387	      tpl_GLY_bonds()
388	    case False{}:
389	      tpl_bonds_HIS(String.eq(res, "HIS"), res)
390	
391	def tpl_bonds_GLU(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
392	  match hit:
393	    case True{}:
394	      tpl_GLU_bonds()
395	    case False{}:
396	      tpl_bonds_GLY(String.eq(res, "GLY"), res)
397	
398	def tpl_bonds_GLN(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
399	  match hit:
400	    case True{}:
401	      tpl_GLN_bonds()
402	    case False{}:
403	      tpl_bonds_GLU(String.eq(res, "GLU"), res)
404	
405	def tpl_bonds_CYS(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
406	  match hit:
407	    case True{}:
408	      tpl_CYS_bonds()
409	    case False{}:
410	      tpl_bonds_GLN(String.eq(res, "GLN"), res)
411	
412	def tpl_bonds_ASP(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
413	  match hit:
414	    case True{}:
415	      tpl_ASP_bonds()
416	    case False{}:
417	      tpl_bonds_CYS(String.eq(res, "CYS"), res)
418	
419	def tpl_bonds_ASN(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
420	  match hit:
421	    case True{}:
422	      tpl_ASN_bonds()
423	    case False{}:
424	      tpl_bonds_ASP(String.eq(res, "ASP"), res)
425	
426	def tpl_bonds_ARG(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
427	  match hit:
428	    case True{}:
429	      tpl_ARG_bonds()
430	    case False{}:
431	      tpl_bonds_ASN(String.eq(res, "ASN"), res)
432	
433	def tpl_bonds_ALA(hit: Bool, +res: String) -> List<&2, String>:
434	  match hit:
435	    case True{}:
436	      tpl_ALA_bonds()
437	    case False{}:
438	      tpl_bonds_ARG(String.eq(res, "ARG"), res)
439	
440	def tpl_bonds_for(+res: String) -> List<&2, String>:
441	  tpl_bonds_ALA(String.eq(res, "ALA"), res)